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如果在尝试注册12306账号时发现身份证已被注册，可能有以下几种原因。
1、可能是您的身份信息已经被他人注册，这种情况下，您可以通过找回密码功能尝试找回已注册的账号，如果找回密码无效，您可能需要联系12306客服来解决问题。
2、如果您使用的是自己的身份证，那可能是之前使用过的手机号或者邮箱已经注册过账号，此时可以尝试使用已注册的手机或邮箱进行登录，然后绑定自己的手机号和邮箱以正常使用账号。
3、还有可能是您的身份信息被冒用，在这种情况下，建议您及时联系铁路部门，注销名下冒用账号并重新注册，您也应该及时报警并联系相关部门处理身份信息泄露问题。
无论哪种情况，如果无法自行解决问题，建议直接联系12306客服寻求帮助，为了保障个人信息安全，请确保在各种网站和应用上正确使用和保管个人信息。